在正洗、反洗、气洗等常规清洗手段均不能有效恢复膜通量的前提下，可考虑对膜系统进行化学清洗。化学清洗的频率一般为1~6个月一次，具体可根据废水水质及污染情况确定。

可采用柠檬酸、草酸、盐酸、氢氧化钠、次氯酸钠等化学药剂配置成清洗剂，让膜组件在药剂中浸泡4~24小时后清洗至中性，并测试水通量。如一次的清洗效果不理想，可对系统进行多次化学清洗。